2011年7月3日，卫生部、上海市人民政府在上海举行了部市会商会议暨进一步深化部市合作协议书签字仪式。卫生部部长陈竺、上海市人民政府市长韩正出席签字仪式，共同签署了《卫生部、上海市人民政府进一步深化部市合作协议书》及《共建共管在沪卫生部管理单位补充协议》，并作重要讲话。上海市人民政府副市长沈晓明主持签字仪式。
陈竺充分肯定了上海市的卫生工作。他指出，近年来，上海的医药卫生体制改革一直走在全国前列，上海在公立医院改革、卫生信息化建设等方面都是国家的试点城市，卫生部一些改革举措注意总结借鉴了上海的经验。当前，正值全党、全国人民深入贯彻党的十七大和十七届五中全会精神，着力实现“十二五”期间良好开局的关键时期，正值深化医药卫生体制改革近期三年重点任务的攻坚阶段，卫生部与上海市人民政府签署卫生合作协议，积极研究共同关心、面对的医改等重大问题，探索新形势下地区卫生事业改革发展的新模式和新机制，争取在重点领域和关键环节取得突破，为全国医改工作探索道路，具有重大意义。
陈竺指出，这次签署《进一步深化部市合作协议书》及《共建共管在沪卫生部管理单位补充协议》，是对原有共建共管协议的进一步扩展和提升，合作共建走向深度，合作内容更加丰富，体现在医疗服务、公共卫生、中医药、食品药品监管、医学科研人才、卫生信息化以及共建共管医院等各方面。卫生部高度重视与上海市的合作，也寄予厚望，将积极给予上海支持和指导，充分发挥上海的特色和优质资源，共同探索，努力推动医药产业创新，推进全国卫生事业改革发展，更好地服务于广大人民群众的身体健康；同时，提高我国疾病预防控制及科学研究的综合实力，为全球的热带病防治事业作出贡献。
韩正在讲话中指出，当前，上海正按照党中央、国务院的部署，积极推进医药卫生体制改革。上海医药卫生事业发展的基础较好，在医疗保障体系、公共卫生体系建设等方面发展较快，经济社会发展也给予了强有力的支撑，改革的前景看好。但是，这些有利条件也意味着人民群众对改革的期盼和要求更高。上海市人民政府将紧紧依托部市合作机制，建立一个有中国特色和上海特点、人民群众得到实惠、充分调动广大医疗卫生工作者积极性、符合上海现在发展阶段的医药卫生体制，不仅实现上海的医改目标，还要努力创造经验，服务国家医改大局。
韩正强调，上海市人民政府与卫生部一直保持着密切的合作关系，部市合作有非常好的基础。2009年，签署了《共建共管在沪卫生部管理医院协议》，通过共建共管实现了合作共赢，上海强化了属地化全行业管理，卫生部管理医院得到了更多支持，上海的医疗服务也更加体现了服务上海、服务长三角、服务全国的宗旨。他提出，寄生虫病所是“国家队”，在这次部市合作中，将把共建共管寄生虫病所与上海市医改及公共卫生工作的需求结合起来，促进上海市预防医学和公共卫生事业的发展。共建共管以后，将联合上海各高校资源，不断提高寄生虫病所科研水平，建立国内外领先、集临床与研究为一体的“中国热带病防治研究中心”，为全国相关疾病防控作出贡献，并进一步提升在国际上的影响力。
当天，陈竺还视察了中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所。国家食品药品监督管理局副局长吴浈，卫生部办公厅、人事司、规划财务司、政策法规司、疾病预防控制局、医政司、医疗服务监管司、科技教育司，中国疾病预防控制中心，国家中医药管理局政策法规与监督司负责人，上海市人民政府秘书长、副秘书长及有关部门负责人等参加了签字仪式。(中华人民共和国卫生部 )
