上海中药行业协会成立于1989年12月,是以上海市中药工商企业为主体的社会团体。现有会员单位两百余家,会员企业覆盖率达到上海市中药行业企业总数的93%。行业主管部门是上海市经济和信息化委员会。
秘书处是行业协会的日常办事机构,下设咨询部、办公室、行业部、培训部、信息办公室、《中成药》杂志编辑部等部门。上海中药行业协会的分支机构有:“中药饮片专业委员会”、“中药制药专业委员会”和“参茸专业委员会”。另有上海市中药行业职业技能培训中心和上海中药行业协会技术咨询服务部。信息平台有网站、微信公众号和《上海中药行业信息》。